Analyse der Populationsdynamik kolonisierender Vancomycinresistenter Enterococcus faecium Isolate aus immunsupprimierten Patienten

Abstract

Vancomycin-resistente Enterococcus faecium sind von zunehmender klinischer Relevanz als humanpathogene Erreger vor allem im Rahmen nosokomialer Infektionen. Zur Ausbruchsdiagnostik und Überwachung im stationären Bereich findet vor allem die Vollgenomsequenzierung zur Stammcharakterisierung und Typisierung Verwendung. Diese hoch sensitive Methode wurde in der vorliegenden Arbeit zur Analyse der klonalen Zusammensetzung von enteralen VRE Populationen bei Hochrisikopatienten genutzt. Es wurden fünf Patienten einer Abteilung für Knochenmarktransplantation über einen Zeitraum von drei Wochen beobachtet. Dabei wurden zu jedem Zeitpunkt 14 Kolonien sequenziert und die Daten für das core genome multi locus sequence typing sowie zur Typisierung des van-Elementes genutzt. Es zeigte sich bei 3 der 5 Patienten eine klonale Diversität der VRE Populationen, die über den beobachteten Zeitraum mit einer dynamischen Veränderung einherging. Neben dem Auftauchen von neuen VRE Isolaten konnte gezeigt werden, dass genetisch nahezu identische van-tragende Plasmide in klonal unterschiedlichen Isolaten nachzuweisen waren. Diese - höchstwahrscheinlich durch horizontalen Gentransfer ausgetauscht - tragen somit zu Populationsheterogenität innerhalb eines Individuums bei. Zur Ausbruchsdiagnostik wird standardmäßig jeweils ein Einzelklon eines kolonialisierten Patienten analysiert. Die vorliegenden Daten zeigten jedoch auch eine Unzulänglichkeit dieses Ansatzes, da die gezeigte Populationsheterogenität nicht ausreichend berücksichtig wird und ein Ausbruchsgeschehen möglicherweise unerkannt bleibt.