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dc.contributor.advisorRarey, Matthias (Prof. Dr.)
dc.contributor.authorFischer, Robert
dc.date.accessioned2020-10-19T12:51:18Z-
dc.date.available2020-10-19T12:51:18Z-
dc.date.issued2012
dc.identifier.isbn978-3-86991-437-4
dc.identifier.urihttps://ediss.sub.uni-hamburg.de/handle/ediss/4528-
dc.description.abstractDie kombinatorische Chemie erlaubt die systematische Synthese einer großen Anzahl von Molekülen in kurzer Zeit. Unter Verwendung von Synthesebausteinen und standardisierten Reaktionsschemata entstehen unterschiedliche Substanzen, die auf einer gemeinsamen Kernstruktur basieren. Diese Moleküle können anschließend mittels eines Hochdurchsatz-Screenings automatisiert auf ihre biologische Aktivität getestet werden. Aus Material- und Kostengründen kann jedoch lediglich eine begrenzte Anzahl von Bausteinen zur Synthese eingesetzt werden. Um die kombinatorische Chemie effektiv nutzen zu können, gilt es, die Bausteine so auszuwählen, dass möglichst viele Kombinationen der Bausteine zu Produkten führen, die den vorher definierten Kriterien entsprechen. Wesentliche Kriterien für die Auswahl der Bausteine sind die physikochemischen Eigenschaften der resultierenden Moleküle, anhand derer zum Beispiel die Bioverfügbarkeit der Moleküle abgeschätzt werden kann. Weiterhin wird oftmals die Ähnlichkeit beziehungsweise Unähnlichkeit zu anderen Molekülen als Kriterium verwendet. Zum einen sollen die Produkte ähnlich zu biologisch aktiven Molekülen sein, zum anderen unähnlich zu unerwünschten Molekülen, um die Suche in eine bestimmte Richtung zu steuern. Soll ein möglichst großer Suchraum exploriert werden, sind Mechanismen erforderlich, die für eine möglichst diverse Auswahl der Bausteine sorgen. Um diese unterschiedlichen Anforderungen zu erfüllen, wurde mit LoFT ein Verfahren für die multikriterielle Optimierung kombinatorischer Bibliotheken entwickelt. Durch die Verwendung des Feature-Tree-Deskriptors ist es möglich, die Ähnlichkeit der Produkte zu einem oder mehreren Anfragemolekülen zu betrachten, ohne die Produkte dafür explizit aus den jeweiligen Reaktanten zusammenzubauen. In Kombination mit Produkteigenschaften, die sich aus den Eigenschaften der Reaktanten ableiten lassen, erfolgt eine effiziente Bewertung der Produkte auf der Ebene der Baugruppen. Die simultane Betrachtung von Ähnlichkeit, Diversität und physikochemischen Eigenschaften führt zu Produkten, die den Anforderungen des jeweiligen Projektes gerecht werden.de
dc.description.abstractCombinatorial chemistry allows for the rapid and systematic synthesis of molecules using a unified reaction scheme. The resulting compounds have a common core, but differ in their so-called R-groups. They can be tested for biological activity using high throughput screening (HTS). Due to the large number of possible combinations, only a small number of building blocks can be selected for screening. In particular, for the effective usage of combinatorial chemistry, the building blocks have to be selected in a way, that the resulting products satisfy given criteria. Essential eligibility criteria of the building blocks are the physicochemical properties of the resulting products, for example to increase the chance for bioavailability. Additionally, molecular similarity is a key concept for selection. The resulting products should be similar to known actives and dissimilar to unwanted compounds, for example known inactive molecules. Furthermore, to explore a larger search space, mechanisms are required that lead to more diverse products. In order to fulfill these requirements, the software tool LoFT was developed for the multi-objective optimization of combinatorial libraries. Incorporating the feature tree descriptor, the similarity of the products to one or more query molecules can be calculated without explicitly building them. In combination with product properties, which can be derived directly from the building blocks, an efficient product-based scoring can be obtained on reactant level. Thus, the simultaneous consideration of similarity, diversity and physicochemical properties leads to products, that satisfy the specific needs of the project.en
dc.language.isodede
dc.publisherStaats- und Universitätsbibliothek Hamburg Carl von Ossietzky
dc.relation.isbasedonMonsenstein und Vanderdat, Münster , 2012
dc.rightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.subjectFeature-Treesde
dc.subjectFokussiertes Bibliotheksdesignde
dc.subjectKombinatorische Chemiede
dc.subjectMultikriterielle Optimierungde
dc.subjectÄhnlichkeitssuchede
dc.subjectFeature-Treesen
dc.subjectFocused Library-Designen
dc.subjectSimilarity Searchingen
dc.subjectCombinatorial Chemistryen
dc.subjectMulti-Objective Optimizationen
dc.subject.ddc004 Informatik
dc.titleVirtuelle Methoden für den Entwurf von fokussierten kombinatorischen Bibliothekenbasierend auf Feature-Tree-Ähnlichkeitde
dc.typedoctoralThesis
dcterms.dateAccepted2012-04-24
dc.rights.ccNo license
dc.rights.rshttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
dc.subject.bcl54.80 Angewandte Informatik
dc.type.casraiDissertation-
dc.type.dinidoctoralThesis-
dc.type.driverdoctoralThesis-
dc.type.statusinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.thesisdoctoralThesis
tuhh.opus.id5733
tuhh.opus.datecreation2012-08-13
tuhh.type.opusDissertation-
thesis.grantor.departmentInformatik
thesis.grantor.placeHamburg
thesis.grantor.universityOrInstitutionUniversität Hamburg
dcterms.DCMITypeText-
tuhh.gvk.ppn725646772
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:18-57332
item.advisorGNDRarey, Matthias (Prof. Dr.)-
item.grantfulltextopen-
item.languageiso639-1other-
item.fulltextWith Fulltext-
item.creatorOrcidFischer, Robert-
item.creatorGNDFischer, Robert-
Enthalten in den Sammlungen:Elektronische Dissertationen und Habilitationen
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